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治療腦腫瘤的方法主要可透過外科手術、放射或化學治療。醫生會按病人的個別情況訂定治療計劃，如病人的病情較輕微，治癒的機會高，手術風險較低的話，醫生會以根治為目的，徹底為病人消除腦內腫瘤。有些病人在手術後，還需接受一段時間的輔助性藥物或放射治療，以減低復發機會。
主要治療方法包括：
外科手術
醫生會為病人進行開臚手術，切除腫瘤和周圍有可能被癌細胞侵佔的組織，這是醫治腦腫瘤的最基本方法。但當腫瘤侵入、包圍或蔓延至一些重要腦組織和神經系統時，手術的風險便會相對提高，切除腫瘤亦會更困難。有時醫生在評估病人的病情後，他可能只切除病人大部分的腫瘤，而剩餘的部分就需要利用放射或化學治療去移除。
現時，由於微創手術日漸成熟，大幅提高了手術的安全性和精確性，為病人進行腦腫瘤的切除範圍亦不斷擴大，這大大增加病人的痊癒率和減低他們的後遺症。
放射治療
放射治療是利用高能量放射元素來破壞癌細胞，防止其增生擴散，並盡量減低對周圍健康細胞的損害。近年，醫生採用較先進的放射療法，例如強度調控放射治療技術(IMRT)、影像導航放射治療技術(IGRT)及動態式弧形放射治療(VMAT)，能提升放射劑量，有效殺死腫瘤的同時，又能減低對正常組織的破壞。
放射治療一般在手術後進行，有時也會與化學治療同時使用。它即時的風險比外科手術低，但亦有可能出現併發症，最常見的有腦水腫、脫髮、頭痛、噁心嘔吐、皮膚變紅及疼痛等。
化學治療
化學治療是以藥物來破壞癌細胞，較常用的藥物包括「替莫唑胺」(Temozolmide)或「卡莫斯丁」(Carmustine,BCNU)。病者口服或通過靜脈注射抗癌藥物後，藥物隨血管到達身體各部位，破壞已擴散癌細胞的生長和分裂。不過抗癌藥物亦會破壞正常細胞，產生一定程度的副作用，如嘔吐、眩暈、脫髮、容易疲倦及受到感染等。
在手術切除腦腫瘤後，醫生亦會考慮把藥物如「卡莫斯丁」植入病人的腦空腔內，直接向癌細胞釋放藥物，這樣可減低藥物擴散到其他部位，影響健康正常的細胞。
標靶藥物治療
標靶藥物治療是較新的治療方法，能特別針對癌細胞作出攻擊，切斷其血液供應，令它們死亡。不過大部分標靶藥物仍在臨床試驗階段，目前並未大規模使用。
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